2020-2021 sezonunda transfer olduğu Orduspor 1967 A.Ş. formasıyla sahaya çıktığı tek maçta olan Ünye 1957 Spor karşılaşmasında sakatlanan ve ciddi bir ameliyat geçiren Emre Yüksektepe, üç yıl aradan sonra Ünye 1957 Spor ile anlaşarak Ordu Futbolu'na geri dönmüştü. Ünye 1957 Spor'un bu sezonki en kritik transferlerinden bir tanesi olan Yüksektepe, takımdan ayrıldı ve Rize'ye transfer oldu.
Futbola Altınova’ya başlayan ve ardından Galatasaray altyapısına transfer olan Emre Yüksektepe, 2011 yılında profesyonel olmuştu. Öncelikle Konyaspor, Şanlıurfaspor ve İstanbulspor kiralanan orta saha, Galatasaray’dan bonservisi ile ayrılarak sırasıyla Büyükşehir Belediyesi Erzurumspor, Çorum Futbol Kulübü, Buca 1928, Cizrespor, Gölcükspor ve Isparta 32 Spor formaları giydi. Emre Yüksektepe Bal'da transfer olduğu Orduspor 1967 A.Ş.'de bir maçta forma giydikten sonra ise sırasıyla Arhavispor, Rize Özel İdarespor ve Kaynaşlı Belediyespor formaları giymişti.
Kariyerinde Süper Lig'de 5 maça çıkan ve yeni sezonda Ünye 1957 Spor'u 3.Lige çıkarmak için uğraşacaklarını söyleyen Emre Yüksektepe ''İnşallah Fair-Play çerçevesinde güzel bir Ünye 1957 Spor izlettiririz. Kaos futbolu olmaz, biliyorsunuz ne kadar alt seviyeye geldikçe ki biz de sonuçta buradayız ama her zaman kalite ister istemez düşüyor. İnşallah güzel bir futbol seyrettiririz, bunun için uğraşacağız.'' demişti. Rize Özel İdarespor'a transfer olan Emre Yüksektepe kariyerinde ise Süper Lig’de 5, 2.Lig’de 15, 3.Lig’de 243 ve Türkiye Kupası’nda 11 maça çıkmıştı.